Contabilidad para pymes en España: guía completa
Obligaciones contables, Plan General Contable, modelos fiscales (303, 200, 347, 111...), IVA, IRPF, recargo de equivalencia y que software necesitas. Todo lo que una pyme o un autónomo debe saber sobre contabilidad en España.

Obligaciones contables de una pyme en España
Libros contables y registros que toda sociedad mercantil debe llevar
Libro diario
Registro cronologico de todas las operaciones económicas de la empresa, día a día. Cada asiento refleja un hecho contable: una venta, un cobro, un pago, una nomina. Es obligatorio para todas las sociedades mercantiles y para los autónomos en estimación directa normal.
Libro de inventarios y cuentas anuales
Incluye el balance de apertura, los balances de sumas y saldos trimestrales, el inventario de cierre y las cuentas anuales (balance, cuenta de perdidas y ganancias, memoria). Se cierra al finalizar cada ejercicio.
Libro registro de facturas emitidas
Registro de todas las facturas que emite la empresa. Incluye número, fecha, destinatario, base imponible y cuota de IVA. Obligatorio para todos los sujetos pasivos de IVA. La AEAT puede requerirlo en cualquier inspeccion.
Libro registro de facturas recibidas
Registro de todas las facturas de proveedores y gastos. Mismo nivel de detalle que el de emitidas. Imprescindible para justificar las deducciones de IVA soportado y los gastos deducibles en el Impuesto de Sociedades.
Libro registro de bienes de inversión
Registro de los activos que la empresa adquiere para uso duradero (vehiculos, maquinaria, equipos informáticos, mobiliario). Necesario para controlar las amortizaciones y las regularizaciones de IVA de bienes de inversión.
Cuentas anuales
Balance de situación, cuenta de perdidas y ganancias, estado de cambios en el patrimonio neto, estado de flujos de efectivo (solo empresas grandes) y memoria. Las pymes pueden presentar modelo abreviado si cumplen los limites.
Importante: las pymes que usen el PGC de pymes pueden presentar cuentas anuales abreviadas, lo que simplifica significativamente el proceso. Además, las microempresas tienen criterios aun más simplificados. Con un ERP como ERPNext, estos libros y registros se generan automáticamente a partir de las operaciones del día a día.
Plan General Contable: lo que necesitas saber
El PGC regula como se contabiliza cada operación. Las pymes tienen una versión simplificada.
PGC completo (RD 1514/2007)
El plan contable general, obligatorio para todas las empresas que superen dos de estos tres limites: activo superior a 4 millones de euros, cifra de negocios superior a 8 millones, o más de 50 empleados. Incluye el marco conceptual, las normas de registro y valoración, las cuentas anuales, el cuadro de cuentas y las definiciones y relaciones contables.
PGC de pymes (RD 1515/2007)
Versión simplificada del PGC para empresas que no superen los limites anteriores durante dos ejercicios consecutivos. Elimina normas complejas como las de instrumentos financieros a valor razonable, coberturas contables y operaciones de cobertura. La mayoría de pymes españolas pueden (y deben) usarlo.
Criterios de microempresas
Las empresas que cumplan al menos dos de estos tres limites durante dos ejercicios pueden aplicar criterios aun más simplificados: activo inferior a 1 millon de euros, cifra de negocios inferior a 2 millones, y menos de 10 empleados. Pueden sustituir el estado de cambios en el patrimonio neto por una nota en la memoria.
Estructura del Plan General Contable
Marco conceptual
Normas de registro y valoración
Cuentas anuales
Cuadro de cuentas
Definiciones y relaciones
Las partes 1, 2 y 3 son obligatorias. Las partes 4 y 5 son voluntarias en su aplicación, pero son la referencia que usan todos los programas contables para organizar las cuentas. En la práctica, si usas un software como ERPNext con localización española, el cuadro de cuentas ya viene preconfigurado según el PGC.
Modelos fiscales que presenta una pyme
Los modelos más habituales y cuando debes presentarlos. No todas las pymes presentan todos.
Modelo 303
Trimestral (abril, julio, octubre, enero)Declaracion trimestral de IVA
El modelo estrella de cualquier pyme. Declaras el IVA repercutido (cobrado a clientes) menos el IVA soportado (pagado a proveedores). Si el resultado es positivo, pagas. Si es negativo, compensas o solicitas devolucion en el modelo del 4T.
Aplica a: Todas las pymes y autónomos en régimen general de IVA
Modelo 390
Anual (enero)Resumen anual de IVA
Resumen de las cuatro declaraciones trimestrales del 303. Debe cuadrar con la suma de los trimestres. Sirve para que la AEAT tenga una visión global de tu actividad a efectos de IVA.
Aplica a: Todas las empresas que presenten el modelo 303
Modelo 111
TrimestralRetenciones e ingresos a cuenta del IRPF
Si tu pyme paga nominas a empleados, facturas a profesionales (con retencion) o rendimientos del capital, debes ingresar las retenciones practicadas. Es la contraparte del IRPF que se le retiene al trabajador o profesional.
Aplica a: Pymes con empleados o que paguen a profesionales con retencion
Modelo 115
TrimestralRetenciones por alquiler de inmuebles
Si tu empresa alquila un local, oficina o nave, debes retener el 19% del alquiler e ingresarlo a Hacienda. El arrendador lo descuenta de su IRPF o Impuesto de Sociedades.
Aplica a: Pymes que paguen alquiler de locales o oficinas
Modelo 200
Anual (julio)Impuesto de Sociedades
La declaracion del impuesto sobre los beneficios de la sociedad. El tipo general es del 25%, pero las pymes de nueva creación tributan al 15% los dos primeros ejercicios con beneficios. Se presenta dentro de los 25 días naturales siguientes a los 6 meses posteriores al cierre del ejercicio.
Aplica a: Todas las sociedades mercantiles (SL, SA, cooperativas)
Modelo 347
Anual (febrero)Declaracion de operaciones con terceros
Si durante el año has realizado operaciones con un cliente o proveedor por importe superior a 3.005,06 euros (IVA incluido), debes declararlas. La AEAT cruza los datos entre empresa y proveedor para detectar discrepancias.
Aplica a: Empresas con operaciones superiores a 3.005,06 euros con un mismo tercero
Modelo 349
Mensual o trimestral, según volumenDeclaracion de operaciones intracomunitarias
Si compras o vendes bienes o servicios a empresas de otros países de la UE (operaciones intracomunitarias), debes declararlas. Es clave para que funcione el sistema de IVA intracomunitario.
Aplica a: Pymes que operen con clientes o proveedores de la UE
Con un ERP como ERPNext, los datos para estos modelos se extraen directamente de la contabilidad y la facturación. No necesitas recopilar información manualmente de diferentes fuentes. El módulo de contabilidad española incluye los informes fiscales preconfigurados para generar los ficheros de presentación.
IVA, IRPF y recargo de equivalencia
Los tres impuestos que más afectan al día a día de una pyme o un autónomo en España
IVA: lo que necesitas saber
- Tipo general: 21%. Reducido: 10% (alimentos, transporte, hosteleria). Superreducido: 4% (pan, leche, medicamentos, libros).
- Declaracion trimestral con el modelo 303 y resumen anual con el 390.
- El IVA soportado (el que pagas a proveedores) se deduce del IVA repercutido (el que cobras a clientes).
- Si el resultado es negativo, compensas en trimestres siguientes o solicitas devolucion en el 4T.
- Los autónomos en módulos tienen régimen simplificado de IVA con cuotas fijas trimestrales.
- Con VeriFactu (obligatorio desde 2027), la AEAT tendrá control en tiempo real sobre tus facturas de IVA.
IRPF para autónomos
- Los autónomos tributan por IRPF (personas fisicas), no por Impuesto de Sociedades.
- Estimación directa normal: contabilidad completa, como una empresa. Obligatoria si facturas más de 600.000 euros.
- Estimación directa simplificada: contabilidad simplificada, con libros registro. La mayoría de autónomos están aquí.
- Estimación objetiva (módulos): cuotas fijas basadas en indicadores como metros cuadrados, empleados o potencia electrica.
- Retenciones en facturas a empresas: normalmente el 15% (7% los dos primeros años de actividad).
- Pagos fraccionados trimestrales con el modelo 130 (estimación directa) o 131 (módulos).
Recargo de equivalencia
- Régimen especial de IVA para comerciantes minoristas (personas fisicas) que venden al consumidor final.
- El proveedor te cobra el IVA normal más un recargo adicional: 5,2% (tipo general), 1,4% (reducido) o 0,5% (superreducido).
- A cambio, NO presentas declaracion de IVA (ni modelo 303 ni 390).
- No puedes deducir el IVA soportado, pero tampoco tienes obligación de llevar libros registro de IVA.
- Es obligatorio para autónomos que vendan productos sin transformarlos al consumidor final (tiendas, comercios).
- Si vendes a empresas (B2B) además de a particulares, necesitas estar en régimen general de IVA.
Software de contabilidad para pymes: opciones
Desde herramientas sencillas hasta ERPs completos. Elige según las necesidades reales de tu negocio.
ERPNext
ERP completo open source
Desde 2.500 euros (implementación)
- Contabilidad española integrada (PGC, IVA, IRPF, modelos fiscales)
- Módulo VeriFactu incluido (obligatorio desde 2027)
- Sin licencias por usuario ni cuotas mensuales
- Facturación, inventario, CRM, RRHH, proyectos incluidos
- 100% open source, sin dependencia de proveedor
Ideal para: Pymes que quieren un sistema completo de gestión, no solo contabilidad
Holded
Software de gestión cloud
Desde 40 euros/mes
- Interfaz moderna y fácil de usar
- Contabilidad y facturación integradas
- Plan gratuito con funcionalidades limitadas
Ideal para: Autónomos y micropymes que buscan simplicidad
Sage 50
Software contable tradicional
Desde 30 euros/mes por usuario
- Muy extendido entre asesorias contables en España
- Localización española completa
- Solido en contabilidad pura
Ideal para: Empresas cuya asesoria trabaja con Sage
A3 / Wolters Kluwer
Software para asesorias
Variable (licencia + mantenimiento)
- Estandar en asesorias y gestores españoles
- Muy completo para obligaciones fiscales
- Soporte técnico extenso
Ideal para: Asesorias que gestionan la contabilidad de multiples clientes
¿Cuándo necesitas un ERP con contabilidad integrada?
Un software de contabilidad independiente funciona bien si tu empresa solo necesita llevar los libros contables y presentar impuestos. Pero cuando tu negocio tiene operaciones reales que generan datos contables, necesitas que todo este conectado.
Con un ERP, cada venta genera automáticamente el asiento contable, actualiza el stock, registra el cobro pendiente y alimenta los informes fiscales. No hay que copiar datos entre programas, no hay errores de reconciliacion y la información esta siempre actualizada.
Senales de que necesitas un ERP:
ERPNext: contabilidad y gestión integradas
ERPNext incluye contabilidad española completa (PGC, IVA, IRPF, modelos fiscales) integrada con facturación, inventario, CRM, compras y RRHH. Todo conectado, sin duplicar datos.
- Plan General Contable español preconfigurado
- Generación automática de asientos desde ventas y compras
- Informes fiscales para modelos 303, 347, 349...
- Módulo VeriFactu incluido para cumplir con 2027
- Sin licencias por usuario ni cuotas mensuales
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